『2度目の世界』で争うことなく九皇と決着をつけ、平和な日々が戻ってきた一同。夏らしく海に遊びに行ったりして、平和な時を楽しんでいた。一方神界では原因不明で卓也達の住む蓮見市に連絡が取れない状態になり、葛葉たちは原因を特定することが出来ていなかった。仕方なく葛葉が直接蓮見市にやって来て調査することになったが、原因は睦月の奇病『ご利益病』のせいだった。ご利益病に翻弄される卓也達の運命はいかに?